Oregon, Gatra.com - Penelitian terbaru menyatakan perbedaan genetik tertentu mungkin memisahkan orang yang jatuh sakit parah dengan COVID-19, dari mereka yang tertular infeksi tetapi sulit mengembangkan gejala seperti batuk. Namun, penelitian ini masih dalam tahap awal, kata para ahli. Livescience.com, 22/04.

Sistem kekebalan tubuh dapat bereaksi terhadap virus, sebagian berkat gen tertentu yang membantu sel menemukan kuman yang tidak dikenal ketika mereka memasuki tubuh. Gen-gen tersebut, yang dikenal sebagai gen human leukocyte antigen (HLA), mengandung instruksi untuk membangun protein yang berikatan dengan patogen. Protein-protein tersebut berfungsi sebagai sinyal peringatan untuk memperingatkan sel-sel kekebalan tubuh. Sel-sel kekebalan, setelah dilatih untuk mengenali sinyal ini, memulai proses pembentukan antibodi untuk menargetkan dan menghancurkan kuman invasif.

Dalam setiap individu, kode gen HLA untuk tiga kelas protein berbeda; dengan kata lain, HLA datang dalam berbagai rasa, dan tergantung pada HLA yang Anda miliki, tubuh Anda mungkin lebih baik atau lebih buruk untuk melawan kuman tertentu - termasuk SARS-CoV-2, virus yang menyebabkan COVID-19. Dalam sebuah studi baru, yang diterbitkan 17 April di Journal of Virology, para peneliti menggunakan model komputer untuk memprediksi kombinasi HLA mana yang paling baik untuk mengikat SARS-CoV-2, dan mana yang paling buruk.

Jika HLA tertentu dapat mengikat dengan baik sebagian besar protein virus, "Kami berharap akan ada respon imun yang lebih protektif," kata penulis Abhinav Nellore dan Dr. Reid Thompson, yang memimpin kelompok riset biologi komputasi di Oregon Health and Science University, kepada Live Science melalui email. Ikatan yang lebih baik berarti bahwa protein virus lebih cenderung dipresentasikan pada sel-sel kekebalan dan mendorong produksi antibodi spesifik, kata para penulis.

"Jika interaksinya tidak stabil, Anda tidak akan memiliki respons [kekebalan] yang tepat," kata Dr. Shokrollah Elahi, seorang profesor di Departemen Kedokteran Gigi dan asisten profesor di Departemen Mikrobiologi Medis dan Imunologi di Universitas Alberta, yang tidak terlibat dalam penelitian ini.

Tetapi ikatan yang stabil, sendirian, tidak menjamin respons kekebalan terbaik, tambah Elahi. Jika HLA mengikat protein virus yang sangat penting bagi kuman untuk bereplikasi dan bertahan hidup, aktivitas antibodi selanjutnya kemungkinan akan menargetkan virus lebih efektif daripada yang didorong oleh protein yang kurang penting, kata Elahi.

"Ini adalah masalah yang tidak kami bahas dalam analisis kami," catat para penulis. Sebagai gantinya, tim fokus pada memprediksi seberapa baik tipe HLA yang berbeda dapat mengikat sinyal SARS-CoV-2. Analisis mereka mengidentifikasi enam tipe HLA dengan kapasitas tinggi untuk mengikat urutan protein SARS-CoV-2 yang berbeda, dan tiga dengan kapasitas rendah untuk melakukannya. Secara khusus, tipe HLA yang dikenal sebagai HLA-B * 46: 01 memiliki kapasitas prediksi terendah untuk mengikat bit SARS-CoV-2.

Jenis HLA yang sama muncul dalam sebuah studi tahun 2003 yang diterbitkan dalam jurnal BMC Medical Genetics, yang menilai pasien yang terinfeksi SARS-CoV, sebuah coronavirus terkait erat yang menyebabkan wabah sindrom pernafasan akut yang parah pada awal 2000-an. Studi ini menemukan bahwa, dalam kelompok pasien keturunan Asia, kehadiran HLA-B * 46: 01 dikaitkan dengan kasus infeksi yang parah. Dalam makalah mereka, kelompok penelitian mencatat bahwa lebih banyak data klinis akan diperlukan untuk mengkonfirmasi koneksi - dan hal yang sama berlaku untuk studi baru SARS-CoV-2, kata Nellore dan Thompson.

"Keterbatasan yang paling substansial dari penelitian kami adalah bahwa ini dilakukan sepenuhnya pada komputer dan tidak melibatkan data klinis dari pasien COVID-19," kata penulis.

"Di dalam tubuh, memiliki begitu banyak hal yang berinteraksi," kata Elahi. HLA mewakili hanya satu bagian dari teka-teki besar dan rumit yang terdiri dari sistem kekebalan tubuh manusia, katanya. Untuk lebih memahami berbagai tanggapan kekebalan terhadap COVID-19, Elahi dan kelompok penelitiannya bertujuan untuk menilai penanda aktivitas sistem kekebalan pada pasien yang terinfeksi dan juga membuat katalog rasio jenis sel kekebalan yang ada dalam tubuh mereka. Sementara mempertimbangkan faktor usia, jenis kelamin, dan faktor demografi lainnya, apa yang disebut profil imunologis ini dapat membantu menentukan kapan dan mengapa penyakit ini berubah pada beberapa pasien.

Data klinis dapat dinilai secara paralel dengan data genetik yang dikumpulkan dari pasien yang sama, tambah Elahi. Demikian pula, Nellore dan Thompson mengatakan bahwa "pengujian COVID-19 harus dipasangkan dengan pengetikan HLA, di mana pun [dan] kapan pun memungkinkan," untuk membantu menentukan bagaimana berbagai tipe HLA berhubungan dengan tingkat keparahan gejala. Kemitraan dengan perusahaan pengujian genetik, biobank dan registrasi transplantasi organ juga dapat menawarkan kesempatan untuk mempelajari tipe HLA pada populasi orang yang lebih besar, kata mereka.

"Kami tidak dapat dengan hati-hati memprediksi pada titik ini siapa yang akan lebih atau kurang rentan terhadap virus karena kami belum menganalisis data hasil klinis apa pun terkait dengan tipe HLA untuk mengetahui bahwa prediksi kami valid," kata para penulis. Jika penelitian di masa depan mendukung gagasan bahwa beberapa gen HLA melindungi orang dari virus, sementara yang lain menempatkan pasien pada risiko yang lebih besar, mereka yang berada dalam kelompok terakhir dapat menjadi yang pertama dalam jalur vaksinasi, tambah mereka.

"Selain memprioritaskan vaksinasi lansia atau mereka yang memiliki kondisi yang sudah ada sebelumnya, seseorang dapat memprioritaskan vaksinasi orang dengan genotipe HLA yang menunjukkan virus SARS-CoV-2 lebih mungkin memberi mereka gejala yang lebih buruk."

Para penulis melanjutkan untuk menganalisis seberapa baik HLA dapat mengikat SARS-CoV-2 dibandingkan dengan coronavirus lain, seperti yang menyebabkan flu biasa dan sering menginfeksi manusia. Mereka mengidentifikasi beberapa bit virus yang dibagi antara SARS-CoV-2 dan setidaknya satu dari virus umum ini, menunjukkan paparan satu kuman dapat melindungi tubuh dari virus yang lain.

"Jika seseorang sebelumnya terpapar pada coronavirus yang lebih umum dan memiliki tipe HLA yang tepat ... maka secara teori dimungkinkan bahwa mereka juga dapat menghasilkan respons kekebalan sebelumnya terhadap novel SARS-CoV-2," kata para penulis. Di sisi lain, paparan terhadap virus yang sama dapat membuat tubuh tidak memiliki perlengkapan untuk melawan yang baru, jika, misalnya, "tubuh menggunakan seperangkat alat lama yang tidak cocok untuk mengatasi masalah baru," kata penulis.